Барбарис сибирский произрастает на скалах и каменистых россыпях, в Альпах и около них в поясе Западного и Восточного Саяна, его можно встретить и на Хамар-Дабане и в Приморском крае. Цветение это растения приходится на май-июнь. В лечебных целей, как привило, собирают корни барбариса, выкапывать их необходимо весной, до того, как началась вегетации, либо осенью. Корни очищаются от земли, режутся на куски и высушиваются в хорошо проветриваемом теплом помещении, можно хранить их и на открытом воздухе. В ряду случаев для заготовки используют и ягоды барбариса. В общей сложности корнях этого растения было обнаружено пять алкалоидов, такие как берберин, пальматин и ряд других. Больше всего в барбарисовых корнях берберина, его содержание составляет в коре растения до 1,3%.

В научной медицине это растение изучено мало, потому особого применения не находит, и все же алкалоид берберин является довольно ценным лекарственным средством, его используют в виде бисульфата берберина, как желчегонное средство при гепатохолецистите, хроническом гепатите, желчнокаменной болезни и холецистите. Берберин способствует понижению артериального давления, он замедляет сердечную деятельность, способен вызвать маточные сокращения, провоцирует отделение желчи. У этого компонента имеется также терапевтическая активность. Ранее его применяли для лечения лейшманиоза и малярии.

В народной медицине барбарисовые корни используются в виде водного отвара, либо настаиваются на водке. Их используют при лечении печени, при возникновении простудных заболеваниях как потогонное средство и препарат от кашля, при маточных кровотечениях, как кровоостанавливающее средство, для снижения кровяного давления при гипертонии, как средство от опухлостей, в некоторых случаях при туберкулезе легких.