Можжевельник обыкновенный одно из самых распространенных растений умеренной зоны Северного полушария нашей планеты. К его естественному ареалу произрастания принадлежат обширные области североамериканского и евразийского континентов, от тропических областей Пакистана и Непала до Сибири и северных областей США, Канады и Европы. Это растение отличается устойчивостью к холодным климатическим условиям и часто встречается в лиственных и смешанных лесах, а также на болотах и горных склонах в северных областях вышеупомянутых континентов. Можжевельник обыкновенный может расти в различных почвах, хотя предпочтительнее всего для этого растения песчаные почвы с умеренными показателями влажности, как воздуха, так и почв, хотя можжевельник также встречается в заболоченных областях с высокими показателями влажности.
В связи с тем, что можжевельник обыкновенные произрастает на обширных областях двух континентов, а также отличается устойчивостью к значительным климатическим колебаниям, у этого растения есть множество разновидностей и подвидов, которые могут значительно отличается друг от друга и ограничиваются более маленьким ареалом.
В частности, существует четыре разновидности можжевельника обыкновенного, которые отличаются по зоне произрастания. Разновидность communіs встречается на европейском субконтиненте и на значительной территории северной Азии, в то время как разновидность depressa встречается в восточной части США и по большей части Канады. Последняя разновидность отличается по форме хвои (более широкая и плоская) и по высоте растения (кусты можжевельника могут достигать высоты в один метр).
Разновидность hemisphaerica произрастает в горах Средиземноморского региона Европы, в то время как разновидность nipponica типична для Японских островов. Также есть отдельные разновидности, которые произрастают в Гренландии, западной части континента Северной Америке, в Приэльбрусье и в альпийских зонах европейского субконтинента.